PRALINE sequence alignment results for job Kin10

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The PRALINE alignment process was completed in 1972.0 seconds. Alignment score = 105436.00 Alignment score per aligned residue pair = 9.52 Sequence identities = 2623 Percent sequence identity = 0.24 Number of sequences = 10 Alignment length = 401 Number of residues = 2776 Number of gaps = 1234

Download the final alignment [kin10_fasta.msf] Download PRALINE raw output file [results.out] Download PSI-BLAST output files

Results colour-coded for amino acid conservation The current colourscheme of the alignment is for amino acid conservation.

The conservation scoring is performed by PRALINE. The scoring scheme works from 0 for the least conserved alignment position, up to 10 for the most conserved alignment position. The colour assignments are: Unconserved 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Conserved   . . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 D28_____CD28__S - - - - - - - - - - - - - - - A N Y K R L E K V G E G T Y G V V Y K A L D L R - - P G Q G Q R V V A SKH___SKH__HELA - - - - - - - - - - - - - - - A K Y D I K A L I G R G S F S R V V R V E H R A - - T R Q - - - P Y A EE1___WEE1__S__ - - - - - - - - - - - - - - - T R F R N V T L L G S G E F S E V F Q V E D P V - - E K T L - - K Y A APK___CAPK__BOV - - - - - - - - - - - - - - - D Q F E R I K T L G T G S F G R V M L V K H M E - - T G N - - - H Y A SVK___HSVK__HER - - - - - - - - - - - - - - - M G F T I H G A L T P G S E G C V F D S S H P D - - Y P Q - - - R V I GFR___EGFR__HUM - - - - - - - - - - - - - - - T E F K K I K V L G S G A F G T V Y K G L - W I P E G E K V K I P V A FES__THIS_IS_VF V L N R A V P K D K W V L N H E D L V L G E Q I G R G N F G E V F S G R - L - - - - R A D N T L V A AF1___RAF1__HUM - - - - - - - - - - - - - - - S E V M L S T R I G S G S F G T V Y K G K - W - - - - H G - - - D V A DGM__PDGF_RECEP - - - - - - - - - - - - - - - D Q L V L G R T L G S G A F G Q V V E A T A H G L S H S Q A T M K V A MOS___CMOS__HUM - - - - - - - - - - - - - - - E Q V C L L Q R L G A G G F G S V Y K A T Y R G - - - - - - - V P V A Consistency 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 5 5 3 4 3 4 4 8 8 5 * 5 7 8 3 * 5 5 4 4 1 2 1 0 0 1 2 3 0 0 0 3 6 8     . . . . . . . . . 60 . . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 D28_____CD28__S L K K I R L E S E D E G V P S T A I - R E I S L L K E L K - D D N I V R L Y D I V H - - - - - - - - SKH___SKH__HELA I K M I E T K Y R - E - - G R E V C E S E L R V L R R V R - H A N I I Q L V E V F E - - - - - - - - EE1___WEE1__S__ V K K L K V K F S - G P K E R N R L L Q E V S I Q R A L K G H D H I V E L M D S W E - - - - - - - - APK___CAPK__BOV M K I L D K Q K V V K L K Q I E H T L N E K R I L Q A V N - F P F L V K L E F S F K - 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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - SKH___SKH__HELA - T Q E - R V Y M V M E L A T G G E L F D R I I A K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - EE1___WEE1__S__ - H G G - F L Y M Q V E L C E N G S L D R F L E E Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - APK___CAPK__BOV - D N S - N L Y M V M E Y V P G G E M F S H L R R I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - SVK___HSVK__HER - V S G - V T C L V L P K Y Q A D L Y T Y L S R R L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GFR___EGFR__HUM - - - T S T V Q L I T Q L M P F G C L L D Y V R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - FES__THIS_IS_VF - - - K Q P I Y I V M E L V Q G G D F L T F L R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AF1___RAF1__HUM - - - K D N L A I V T Q W C E G S S L Y K H L H - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - DGM__PDGF_RECEP E L Y S N A L P V G F S L P S H L N L T G E S D G G Y M D M S K D E S I D Y V P M L D M K G D I K Y MOS___CMOS__HUM A G S N S L G T I I M E F G G N V T L H Q V I Y G A A G H P E G D A - - - - - - - - - - - - - - - - Consistency 0 1 1 4 1 3 5 3 7 6 5 6 4 3 4 3 3 3 7 3 3 3 6 4 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0     . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 D28_____CD28__S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P K D Q P L G A D I V K K F M M Q L C K G SKH___SKH__HELA - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G S F T - - - E R D A T R V L Q M V L D G EE1___WEE1__S__ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G Q L S R L D E F R V W K I L V E V A L G APK___CAPK__BOV - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G R F S - - - E P H A R F Y A A Q I V L T SVK___HSVK__HER - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N P L G - - - R P Q I A A V S R Q L L S A GFR___EGFR__HUM - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E H K D N I G S Q Y L L N W C V Q I A K G FES__THIS_IS_VF - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T E G A R L R M K T L L Q M V G D A A A G AF1___RAF1__HUM - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V Q E T K F Q M F Q L I D I A R Q T A Q G DGM__PDGF_RECEP A D I E S P S Y M A P Y D N Y V P S A P E R T Y R A T L I N D S P V L S Y T D L V G F S Y Q V A N G MOS___CMOS__HUM - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G E P H C R T G G Q L S L G K C L K Y S L D V V N G Consistency 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 4 2 4 1 3 1 3 2 3 5 3 3 4 4 3 6 6 5 3 7     . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240 . . . . . . . . . 250 D28_____CD28__S I A Y C H S H R I L H R D L K P Q N L L I - - - N K D G N L K L G D F G L A R A F - G V P L R A Y T SKH___SKH__HELA V R Y L H A L G I T H R D L K P E N L L Y Y H P G T D S K I I I T D F G L A S A R K K G D - D C L M EE1___WEE1__S__ L Q F I H H K N Y V H L D L K P A N V M I - - - T F E G T L K I G D F G M A S V W P V P R - - - - G APK___CAPK__BOV F E Y L H S L D L I Y R D L K P E N L L I - - - D Q Q G Y I Q V T D F G F A K R V K G - - - - - R T SVK___HSVK__HER V D Y I H R Q G I I H R D I K T E N I F I - - - N T P E D I C L G D F G A A C F V Q G S R S S P F P GFR___EGFR__HUM M N Y L E D R R L V H R D L A A R N V L V - - - K T P Q H V K I T D F G L A K L L G A - - E E K E Y FES__THIS_IS_VF M E Y L E S K C C I H R D L A A R N C L V - - - T E K N V L K I S D F G M S R E A A D - - G I - - Y AF1___RAF1__HUM M D Y L H A K N I I H R D M K S N N I F L - - - H E G L T V K I G D F G L A T V - - K - - S R - - W DGM__PDGF_RECEP M D F L A S K N C V H R D L A A R N V L I - - - C E G K L V K I C D F G L A R D I M R - - D S - N Y MOS___CMOS__HUM L L F L H S Q S I V H L D L K P A N I L I - - - S E Q D V C K I S D F G C S E K L E D L L C F Q T P Consistency 6 4 8 7 6 5 4 4 5 7 9 7 * 8 6 5 5 * 7 7 7 0 0 0 3 4 3 3 3 7 5 8 4 * * * 5 8 4 3 3 2 3 0 0 1 2 0 1 2     . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300 D28_____CD28__S H E I V - T - - - - - - - L W Y R A P E V L L G G - - K Q Y S T G V D T W S I G C I F A E M C N - R SKH___SKH__HELA K T T C G T - - - - - - - P E Y I A P E V L V R - - - K P Y T N S V D M W A L G V I A Y I L L S - G EE1___WEE1__S__ M E R E G D - - - - - - - C E Y I A P E V L A N - - - H L Y D K P A D I F S L G I T V F E A A A - N APK___CAPK__BOV W T L C G T - - - - - - - P E Y L A P E I I L S - - - K G Y N K A V D W W A L G V L I Y E M A A - G SVK___HSVK__HER Y G I A G T - - - - - - - I D T N A P E V L A G - - - D P Y T T T V D I W S A G L V I F E T A V - H GFR___EGFR__HUM H A E G G - - K V P - - - I K W M A L E S I L H - - - R I Y T H Q S D V W S Y G V T V W E L M T F G FES__THIS_IS_VF A A S G G L R Q V P - - - V K W T A P E A L N Y - - - G R Y S S E S D V W S F G I L L W E T F S L G AF1___RAF1__HUM S G S Q Q V - E Q P T G S V L W M A P E V I R M Q D N N P F S F Q S D V Y S Y G I V L Y E L M T - G DGM__PDGF_RECEP I S K G S T - Y L P - - - L K W M A P E S I F N - - - S L Y T T L S D V W S F G I L L W E I F T L G MOS___CMOS__HUM S Y P L G G - - - - - - T Y T H R A P E L L K G - - - E G V T P K A D I Y S F A I T L W Q M T T K - Consistency 3 4 3 2 5 3 0 0 0 1 0 0 0 4 4 5 4 * 8 * 6 8 3 3 0 0 0 4 2 8 6 3 3 5 * 6 7 8 5 8 7 6 6 5 7 5 4 5 0 4     . . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 D28_____CD28__S K P I F S G D S E I - - - - D Q I F K I F R V L G T P N E A I W P D I V Y L P D F K P S F P Q W R R SKH___SKH__HELA T M P F - - - - - E D - - - D N R T R L Y R Q I - - - - - - - - - - L R G K Y S Y S G E P W P - - - EE1___WEE1__S__ I V L P D N G Q S W Q - - - K L R S G D L S D A - - - - - - - - - - P R L S S T D N G S S L T S S S APK___CAPK__BOV Y P P F F A D Q P - - - - - - - - I Q I Y E K I - - - - - - - - - - V S G K V R F P S - - - - - - - SVK___HSVK__HER N A S L F S A P R G P K R G P C D S Q I T R I I - - - - - - - - - - R Q A Q V H V D E - - - - - - - GFR___EGFR__HUM S K P Y D G I - - - - - - - - P A S E I S S I L E K - - - - - - - G E R - - L P - - - - Q P P - 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- P - - - - - T I D Q I L A T D E V C W APK___CAPK__BOV - - - - - - - - H F S S D L K D L L R N L L Q V D L T K R - - F G N L K D G V N D I K N H K - - - - SVK___HSVK__HER - - - - - - - - F S P H P E S R L T S R Y R S R A A G N N - - R P P Y T R P A W T R Y Y K M D I D V GFR___EGFR__HUM - - - - - - - - I C T I D V Y M I M V K C W M I D A D S R P K F R E L I I E F S K M A R - - - - - - FES__THIS_IS_VF - - - - - - - - L C P D A V F R L M E Q C W A Y E P G Q R P S F S A I Y Q E L - - - - - - - - - - - AF1___RAF1__HUM - - - - - - - - N C P K A M K R L V A D C V K K V K E E R P L F P Q I L S S I E L L Q H - - - - - - DGM__PDGF_RECEP - - - - - - - - H A S D E I Y E I M Q K C W E E K F E T R P P F S Q L V L L L E R L L G E G Y K K K MOS___CMOS__HUM - - - - - - - - L P G Q R L G D V I Q R C W R P S A A Q R P S A R L L L V D L T S L K A - - - - - - Consistency 0 0 0 0 0 0 0 0 3 3 4 3 3 4 3 4 7 6 4 4 5 4 4 3 4 4 3 4 8 2 0 4 1 1 3 1 1 3 5 2 3 4 3 2 1 0 0 1 0 0     . D28_____CD28__S S SKH___SKH__HELA M EE1___WEE1__S__ V APK___CAPK__BOV - SVK___HSVK__HER - GFR___EGFR__HUM - FES__THIS_IS_VF - AF1___RAF1__HUM - DGM__PDGF_RECEP Y MOS___CMOS__HUM - Consistency 0